Университеттеги билим берүү иши Кыргыз Республикасынын мамлекеттик билим берүү стандарттарынын талаптарына, ошондой эле Болон келишиминин негизги жоболоруна ылайык уюштурулган. Муну менен университетти КМШ жана алыскы чет өлкөлөрдүн бирдиктүү билим берүү мейкиндигине интеграциялоо үчүн шарттар түзүлүүдө.

Учурда бакалавриаттын 14 багыты, магистратуранын 7 багыты жана PhDнин 2 багыты боюнча даярдыктар жүрүп жатат.
Университетте Мамлекеттик жана коомдук башкаруунун жогорку мектеби(МКБЖМ) иштейт, анда кошумча кесиптик билим берүү, кесиптик кесипкөйлүгүн жогорулатуу, КРЭАУнун окутуучулары менен кызматкерлеринин педагогикалык, психологиялык жана методологиялык чеберчилиги, ошондой эле Кыргызстандын башка жогорку окуу жайларынын программалары ишке ашырылат.
2016-жылы университетте Европанын (Болгария, Словакия, Италия, Швейцария, Латвия, Польша, Беларусь, Россия) жана Азиянын (Индия, Түркия, Кытай)чет өлкөлүк өнөктөштөрү менен кол коюлган келишимдерге жана макулдашууларга ылайык кош дипломдор программасы ишке киргизилген
Үчүнчү муундагы мамлекеттик билим берүү стандарттарына ылайык университетте ишке ашырылып жаткан жогорку билим берүүнүн негизги билим берүү программалары жөнүндө маалымат таблицада келтирилген.